De in Harelbeke geboren Peter Benoit kreeg zijn eerste muzieklessen van zijn vader. Hij studeerde compositie aan het Koninklijk Conservatorium van Brussel, en vervolmaakte zich na zijn studie in de orkestdirectie bij de toenmalige directeur van de Muntschouwburg.
Na enkele omzwervingen in Duitsland en een verblijf in Parijs als dirigent van het orkest van Jacques Offenbach, keerde hij in 1863 terug naar Brussel. In 1867 werd hij de directeur van de Vlaamse muziekschool, dat in 1898 tot het Koninklijk Vlaams Muziekconservatorium van Antwerpen werd omgevormd.